По ОПТ се предвижда да бъдат реализирани 17 приоритетни проекта, които са включени в индикативния списък с приоритетни проекти, за финансиране от програмата. При възникване на непредвидени обстоятелства или риск от загуба на средства от евпропейските фондове при изпълнението на някой от приоритетните проекти, Управляващият орган може да го замени с някой от индикативния списък с алтернативни проекти. Бенефициентите по приоритетните и алтернативните проекти са предварително определени